این بخش فعالیت خود را از سال 1375 در مرکز تحقیقات کشاورزی مغان شروع کرد. با وجود شبكه های بزرگ آبیاری و زهكشی و پیشرفت مكانیزاسیون کشاورزی در منطقه و همچنین وجود دو بنگاه  اقتصادی بزرگ در حوزه کشاورزی و دامپروری کشور (شرکت های کشت و صنعت و دامپروری مغان و پارس) در شمال استان اردبیل اهمیت فعالیت تحقیقاتی بخش فنی و مهندسی در این منطقه بیشتر نمایان می شود. این بخش با فعالیت در دو حوزه آبیاری و زهكشی و مكانیزاسیون و ماشینهای کشاورزی تاکنون موفق به اجرای بیش از 100 فقره طرح تحقیقاتی در حوزه های تعریف شده در راستای نیازهای بخش  اجرا و اکثرا بصورت تقاضا محور انجام شده است. علاوه بر آن، بیش از 30 فقره نشریه فنی و ترویجی، یافته های قابل ترویج و فناوری قابل تجاری سازی از نتایج پژوهشهای کاربردی بخش تهیه و ثبت شده است.

اهداف عمده و محورهای تحقیقاتی 

آبیاری و زهکشی

 1-تعيين راندمان هاي انتقال ، توزيع و كاربرد آب در شبكه آبياري مغان

2-بررسي اثرات تراكم خاك روي عملكرد محصولات مختلف

3-بررسي مبارزه با ني و علف هاي هرز انهار آبياري و زهكشي منطقه

4-بررسي ميزان تاثير زهكش هاي زيرزميني برروي وضعيت اراضي منطقه

5-بررسي امكان استفاده مجدد از زه آبها در آبياري 

6-تحقيق روي اثرات زيست محيطي شبكه آبياري مغان

7-بررسي كارآيي روشهاي مختلف آبياري سيستم هاي تحت فشار در استان

8-بررسي و تعيين طول بهينه فاروها با توجه به خصوصيات خاك در منطقه مغان

9-تعيين و بررسي مناسب ترين زمان آبياري تكميلي در ديمزارهاي منطقه مغان

10-بررسي و تعيين كارآيي مصرف آب محصولات مختلف در منطقه و ارائه راهكارهاي مناسب جهت افزايش آن

11-بررسي مناسبترين روش كم آبياري محصولات رايج استان

12-تعيين دور و ميزان آب آبياري محصولات عمده استان

13-بررسي مسايل ومشكلات شبكه كانالتهاي احداث شده در منطقه و ارائه راهكار

ماشین های کشاورزی

1-برآورد شاخص هاي مكانيزاسيون (درجه ،سطح ، ظرفيت )براي عمليات مختلف

2-تعيين تعداد روزهاي قابل كار براي عمليات مختلف كشاورزي

3-بررسي اثرات زيرشكني بر عملكرد و كارآيي مصرف آب محصولات مختلف كشاورزي

4-بررسي روشهاي توزيع كود و بذر بر عملكرد و روش هاي كاهش مصرف اين نهاده ها

5-بررسي اثرات روش هاي مديريت بقاياي گياهي بر خصوصيات فيزيكي و ذخيره مواد آلي خاك

6-تعيين هزينه هاي تعمير و نگهداري تراكتور ،كمباين و ديگر ادوات كشاورزي و تعيين عمر اقتصادي استفاده از ماشين آلات و ادوات كشاورزي